广东快乐十分下注:宏轉錄組測序

宏轉錄組技術介紹

广东快乐十分胆拖表 www.lzyaey.com.cn 宏轉錄組學是一門在整體水平上研究某一特定環境、特定時期群體生物全基因組轉錄情況以及轉錄調控規律的學科。宏轉錄組測序可原位研究特定生境特定時空下微生物群落中活躍菌種的組成以及活性基因的表達情況,結合理化因素的檢測,宏轉錄組可研究多樣本間由于理化等指標的差異,時空上不同微生物群落間活躍成分組成的差異分析。

實驗設計到信息分析一站式服務?

提供全面的宏轉錄組研究的方案設計和售后服務,豐富的標準分析以及個性化分析多角度闡明不同環境下微生物群落的功能和差異機制。

  • 方案確定

  • 提取檢測

  • 建庫測序

  • 信息分析

  • 售后服務

分析內容

metatran-

技術策略與送樣要求

?測序策略

Illumina Hiseq PE150測序

?RNA送樣要求

RNA濃度?≥65ng/μl(Qubit),RNA質量≥6μg(Qubit),RIN≥7.0;28S/18S≥1.0。

產品優勢與項目經驗

?豐富的項目經驗與專業的信息團隊,提供全面準確的信息分析。

高水平分析團隊

豐富的項目經驗

全面的分析內容

專業的售后服務

成功案例

物種注釋

使用 diamond軟件將質控后的高質量測序數據比對到 nr數據庫,得到樣品的物種組成和相對豐度信息。

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Unigene功能注釋

使用 BLAST軟件將非冗余基因集的序列與 Swiss-prot、TrEMBL 、GO、COG 、Pfam 和KEGG 數據庫比對,了解環境中微生物具有的活性功能。

基因表達量差異分析

基因表達具有時間和空間特異性,在兩個不同條件下,表達水平存在顯著差異的基因或轉錄本,稱之為差異表達基因(DEG)。

deg
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差異表達基因聚類分析

通過對差異基因進行聚類分析,可以觀察各樣品在基因表達水平上的差異關系。

差異基因富集分析

對差異基因做功能富集分析,有助于了解微生物對不同環境的響應機制。

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Q1.宏轉錄組與宏基因組差別?

宏基因組是以環境中所有微生物的DNA為研究對象,宏轉錄組以環境中所有微生物的RNA為研究對象,宏基因組告訴我們環境中所有微生物能夠做什么,而宏轉錄組告訴我們環境中所有微生物正在做什么。