广东快乐十分最快开奖软件下载:醫學Nanopore全基因組重測序

產品介紹

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重測序是對已知基因組序列的物種進行不同個體的基因組測序,并進一步對個體或群體進行差異性分析。

Nanopore測序借助單個分子通過納米孔時引起孔兩側電位差來實現信號檢測,納米孔的直徑僅允許單個核苷酸聚合物通過,而ATCG四種堿基的帶電性質不同,因此通過電信號差異特征即可檢測出通過納米孔的堿基類型,從而實現測序。

技術優勢

長讀長

理論上Nanopore技術的測序平均讀長能夠達到幾十到上百 Kb,最長讀長能達到2 Mb以上級別;由于讀長長,有以下優勢:

1、直接跨越結構變異斷點,利于變異(拷貝數變異CNV、插入、缺失、易位和倒位)檢測;

2、直接跨越串聯重復序列、高GC/AT序列、高度多態性區域、高度同源區域等特殊區域,檢測能力大大優于二代測序。

低成本

相比其他三代測序技術,ONT測序樣本處理極其簡單,無需DNA聚合酶、連接酶和dNTPs,測序價格低;

無需PCR擴增

避免二代測序中PCR擴增可能引入的錯誤;

可直接讀取堿基修飾信息

如DNA甲基化5mC、6mA(詳見三代甲基化,此處弄個鏈接跳到三代甲基化產品界面)等,無須像二代測序需要經過重硫酸鹽轉化或者免疫沉淀富集實驗。

樣品要求

不同類型的樣品詳細要求歡迎來電咨詢或聯系當地銷售。

實驗流程

實驗流程按照 Oxford Nanopore Technologies(ONT) 公司提供的標準 protocol 執行,包括樣品質量檢測、文庫構建、文庫質量檢測和文庫測序等流程。

結果展示

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重測序分析流程圖
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樣品結構變異檢測

?常見問題

片篩和非片篩文庫的區別是什么?

片篩即片段篩選,如果片篩文庫則會選擇長的DNA片段,因此需要的DNA量要多;非片篩文庫即不進行片段篩選的打斷文庫,即將DNA打斷成固定長度。

片篩文庫得到的序列相對更長,適用于基因組組裝。而非片篩文庫得到的read相對較短,適用于重測序或甲基化檢測。

重測序一般要測多少數據量?

原則上講數據量的越多,檢測到的結構變異越多越準。由于經費限制推薦至少測15X的數據量,如果是腫瘤等特殊組織建議測15X以上的數據量。具體原因可參考下述鏈接:

https://mp.weixin.qq.com/s/2hQfOYksbkJaONrPwYhWUw